Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rb1cc1Q9ESK9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rb1cc1Q9ESK9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms