Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp29Q9ES63 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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