Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tfip11Q9ERA6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tfip11Q9ERA6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms