Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER73

Elp4, Elongator complex protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp4Q9ER73 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elp4Q9ER73 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elp4Q9ER73 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elp4Q9ER73 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Elp4Q9ER73 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elp4Q9ER73 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elp4Q9ER73 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elp4Q9ER73 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elp4Q9ER73 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elp4Q9ER73 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elp4Q9ER73 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elp4Q9ER73 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Elp4Q9ER73 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elp4Q9ER73 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elp4Q9ER73 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elp4Q9ER73 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Elp4Q9ER73 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elp4Q9ER73 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elp4Q9ER73 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elp4Q9ER73 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elp4Q9ER73 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elp4Q9ER73 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Elp4Q9ER73 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Elp4Q9ER73 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms