Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Capn12Q9ER56 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms