Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG3

Scel, Sciellin, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScelQ9EQG3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ScelQ9EQG3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ScelQ9EQG3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms