Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Clstn1Q9EPL2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn1Q9EPL2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms