Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Aph1cQ9DCZ9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms