Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3s1Q9DCR2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3s1Q9DCR2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3s1Q9DCR2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap3s1Q9DCR2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s1Q9DCR2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s1Q9DCR2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s1Q9DCR2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s1Q9DCR2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s1Q9DCR2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s1Q9DCR2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s1Q9DCR2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s1Q9DCR2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s1Q9DCR2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s1Q9DCR2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s1Q9DCR2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s1Q9DCR2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s1Q9DCR2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s1Q9DCR2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap3s1Q9DCR2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms