Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCF9

Ssr3, Translocon-associated protein subunit gamma, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr3Q9DCF9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr3Q9DCF9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr3Q9DCF9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr3Q9DCF9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr3Q9DCF9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr3Q9DCF9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr3Q9DCF9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr3Q9DCF9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr3Q9DCF9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr3Q9DCF9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr3Q9DCF9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr3Q9DCF9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr3Q9DCF9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr3Q9DCF9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr3Q9DCF9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr3Q9DCF9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr3Q9DCF9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr3Q9DCF9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr3Q9DCF9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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