Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubiad1Q9DC60 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubiad1Q9DC60 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubiad1Q9DC60 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubiad1Q9DC60 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubiad1Q9DC60 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubiad1Q9DC60 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubiad1Q9DC60 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubiad1Q9DC60 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubiad1Q9DC60 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubiad1Q9DC60 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubiad1Q9DC60 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubiad1Q9DC60 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubiad1Q9DC60 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubiad1Q9DC60 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms