Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smg9Q9DB90 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smg9Q9DB90 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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