Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fundc1Q9DB70 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fundc1Q9DB70 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms