Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pop5Q9DB28 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pop5Q9DB28 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms