Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TrmuQ9DAT5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrmuQ9DAT5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms