Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Asf1bQ9DAP7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms