Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DAE8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DAE8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9DAE8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9DAE8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9DAE8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms