Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9DA42 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9DA42 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9DA42 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9DA42 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9DA42 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9DA42 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9DA42 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DA42 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DA42 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DA42 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DA42 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DA42 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DA42 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DA42 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DA42 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DA42 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DA42 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DA42 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DA42 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DA42 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DA42 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DA42 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DA42 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DA42 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DA42 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DA42 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DA42 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DA42 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DA42 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DA42 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9DA42 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9DA42 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9DA42 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9DA42 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9DA42 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9DA42 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9DA42 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9DA42 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9DA42 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9DA42 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9DA42 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9DA42 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9DA42 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9DA42 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9DA42 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9DA42 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9DA42 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9DA42 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9DA42 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9DA42 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9DA42 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9DA42 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9DA42 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9DA42 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9DA42 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9DA42 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9DA42 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9DA42 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9DA42 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9DA42 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9DA42 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9DA42 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9DA42 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9DA42 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9DA42 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9DA42 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9DA42 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9DA42 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9DA42 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9DA42 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9DA42 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9DA42 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9DA42 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9DA42 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9DA42 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9DA42 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9DA42 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9DA42 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9DA42 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9DA42 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9DA42 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q9DA42 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q9DA42 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q9DA42 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DA42 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DA42 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DA42 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DA42 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DA42 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DA42 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DA42 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DA42 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DA42 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DA42 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DA42 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DA42 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DA42 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DA42 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DA42 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms