Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Samd8Q9DA37 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd8Q9DA37 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms