Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4bQ9D9F7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms