Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg7Q9D906 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg7Q9D906 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg7Q9D906 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg7Q9D906 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg7Q9D906 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg7Q9D906 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg7Q9D906 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg7Q9D906 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg7Q9D906 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg7Q9D906 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg7Q9D906 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg7Q9D906 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg7Q9D906 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg7Q9D906 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg7Q9D906 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg7Q9D906 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg7Q9D906 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg7Q9D906 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms