Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx5Q9D8U8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms