Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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