Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
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Gtf3c6Q9D8P7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Gtf3c6Q9D8P7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Gtf3c6Q9D8P7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Gtf3c6Q9D8P7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Gtf3c6Q9D8P7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Gtf3c6Q9D8P7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gtf3c6Q9D8P7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Gtf3c6Q9D8P7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Gtf3c6Q9D8P7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gtf3c6Q9D8P7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
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Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf3c6Q9D8P7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf3c6Q9D8P7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf3c6Q9D8P7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf3c6Q9D8P7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf3c6Q9D8P7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Gtf3c6Q9D8P7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf3c6Q9D8P7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf3c6Q9D8P7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf3c6Q9D8P7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf3c6Q9D8P7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf3c6Q9D8P7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf3c6Q9D8P7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf3c6Q9D8P7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf3c6Q9D8P7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf3c6Q9D8P7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gtf3c6Q9D8P7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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