Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alkbh4Q9D8F1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms