Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl4Q9D8E6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms