Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chmp4bQ9D8B3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp4bQ9D8B3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms