Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2af1Q9D883 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2af1Q9D883 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms