Protein–RNA interactions for Protein: Q9D844

Dnajc4, DnaJ homolog subfamily C member 4, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc4Q9D844 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc4Q9D844 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc4Q9D844 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnajc4Q9D844 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc4Q9D844 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms