Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Tmem54Q9D7S1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Tmem54Q9D7S1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Tmem54Q9D7S1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Tmem54Q9D7S1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Tmem54Q9D7S1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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