Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capns2Q9D7J7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms