Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nsmce1Q9D720 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms