Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Nop56Q9D6Z1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Nop56Q9D6Z1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Nop56Q9D6Z1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Nop56Q9D6Z1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nop56Q9D6Z1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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