Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbe1Q9D6Y9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbe1Q9D6Y9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms