Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec23bQ9D662 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sec23bQ9D662 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms