Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Rab11fip1Q9D620 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab11fip1Q9D620 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Rab11fip1Q9D620 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Rab11fip1Q9D620 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Rab11fip1Q9D620 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Rab11fip1Q9D620 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Rab11fip1Q9D620 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Rab11fip1Q9D620 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab11fip1Q9D620 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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