Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4f1Q9D5Q6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms