Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
4930556J24RikQ9D4U7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms