Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lonrf3Q9D4H7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lonrf3Q9D4H7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms