Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gcc1Q9D4H2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gcc1Q9D4H2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms