Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Syce1Q9D495 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syce1Q9D495 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms