Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D454 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D454 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D454 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D454 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D454 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D454 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D454 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D454 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D454 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D454 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D454 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D454 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D454 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D454 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D454 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D454 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D454 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D454 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D454 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D454 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D454 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D454 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D454 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D454 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D454 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D454 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D454 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D454 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D454 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D454 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D454 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D454 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D454 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D454 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D454 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D454 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D454 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D454 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D454 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D454 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D454 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D454 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D454 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D454 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D454 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D454 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D454 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D454 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D454 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D454 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D454 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D454 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D454 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D454 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D454 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D454 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D454 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D454 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D454 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D454 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D454 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D454 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D454 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D454 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D454 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D454 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D454 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D454 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D454 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D454 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D454 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D454 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D454 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D454 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D454 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D454 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D454 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D454 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D454 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D454 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D454 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D454 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D454 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D454 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D454 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D454 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D454 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D454 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D454 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D454 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D454 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D454 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D454 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D454 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D454 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D454 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D454 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D454 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D454 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms