Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpn3Q9D3W4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpn3Q9D3W4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms