Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rufy3Q9D394 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rufy3Q9D394 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms