Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lamp5Q9D387 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lamp5Q9D387 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms