Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms