Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Z4

Senp8, Sentrin-specific protease 8, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp8Q9D2Z4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Senp8Q9D2Z4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Senp8Q9D2Z4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Senp8Q9D2Z4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Senp8Q9D2Z4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Senp8Q9D2Z4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Senp8Q9D2Z4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Senp8Q9D2Z4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Senp8Q9D2Z4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Senp8Q9D2Z4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Senp8Q9D2Z4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms