Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q9D2Q3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D2Q3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms