Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Creb3l4Q9D2A5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Creb3l4Q9D2A5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Creb3l4Q9D2A5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Creb3l4Q9D2A5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Creb3l4Q9D2A5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms