Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Batf3Q9D275 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Batf3Q9D275 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms